Права категории B

Тельная Елизавета Андреевна + serlina1624@gmail.com Дата рождения: 06 февраля 1998 Гражданство: Россия Образование 2015 – 2019: Бакалавриат, Санкт-Петербургский государственный университет, физический факультет, кафедра молекулярной биофизики и физики полимеров. 2019 – 2021: Магистратура, Санкт-Петербургский государственный университет, физический факультет, кафедра молекулярной биофизики и физики полимеров. 2021 – 2023: Магистратура, НТУ “Сириус”, биоинформатика и вычислительная биология. С 2021 года аспирант физического факультета СПбГУ. Кафедра молекулярной биофизики и физики полимеров. Опыт работы Санкт-Петербургский государственный университет, 2019, Лаборант-исследователь, работа в рамках гранта РНФ№ 16-13 -10090 Люминесцирующие нанокластеры металлов в нуклеопротеиновых матрицах. • Обязанности: приготовление растворов, постановка форезов, получение спектров люминисценции. Дальневосточный федеральный университет, 08.2022, Старший инженер, работа в рамках студенческой практики. • Обязанности: поиск последовательностей в базах данных NCBI, BLAST, обработка данных NGS (BWA, Bowtie2, SPAdes, Trinity, QUAST, BLASTn, Trimmomatic, FastQC, CD-HIT, MAFFT, IGV). Написание пайплайна обработки данных секвенирования. Навыки С осени 2016 года занималась научными исследованиями в лабораториях СПбГУ, в рамках гранта РФФИ №18-08-01500 “Механизмы самосборки надмолекулярных структур на основе архитектурных белков хроматина” 2017-2020. Из лабораторных методов более всего освоила ИК-спектроскопию (в том числе и НПВО), также электрофорез в ПААГ, УФ-спектроскопию. В процессе учебы также получила практические навыки по атомно-силовой микроскопии, ЯМР, рентгеноструктурному анализу. На теоритических занятиях разбирала принцип работы таких методов исследования, как масс-спектрометрия, седиментация, двойное лучепреломление, малоугловое рассеяние. В период обучения работала в таких программах как MATLAB, Labview, Rstudio. В 2020 году проходила стажировку в зарубежном университете (KAUST). Работала с клеточными культурами, получила навыки в наработке и очистке белка (афинная хромотография, гель-фильтрация, ПЦР). Также получала и обрабатывала данные по FRET спектроскопии. За это время сильно подтянула английский, в том числе и профессиональные термины. С 2021 года занимаюсь биоинформатикой. Тема диссертации - пайплайн для обработки данных NGS дуплицированных геномов и построение филогенетических отношений (RaxML, MrBayes). Также в процессе обучения получила навыки по структурной биофнформатике: GROMACS, ESPResSO, rosetta, FoldX, AutoDock Vina (также есть некоторые навыки по докингу). Визуализировала в VMD, PyMol. Делала проекты по хемоинформатике (rdkit, pytorch, ORCA).Работала с пакетами python, такими как: rdkit, modeller, nglview, mdtraj biopython, pysam. Проходила курсы по работе с реляционными базами данных (SQL), есть начальные навыки по работе с С++ и Java. Для второй магистрской диссертации писала скрипты на python и bash, а также slurm. Немного оринетируюсь в машинном обучении (SciPy, TensorFlow, PyTorch, Scikit-learn, Seaborn, Pandas). Умею работать с Git. Публикации и конференции Участвовала во многих студенческих конференциях и школах, есть несколько научных публикаций. Профиль автора в РИНЦ: 1152524 Профиль автора в SCOPUS: 57213147838 Дополнительные сведения Во время учебы была членом студенческого совета, представляла интересы студентов в учебно-методической комиссии факультета. Участовала в организации множества мероприятий в университете и на факультете (мероприятия на ~1000 человек), и как волонтер и как главный организатор. Получила опыт публичных выступлений. Коммуникабельна, умею быстро улаживать конфликты и координировать работу команды. Уровень английского B2.